百玄传故事设定的时代是现代，讲述一个妖怪与人类共处的年代里，人类所占的比率远比妖怪多，所以一直会有种族之间的歧视，妖的性格极为不稳定时，就会转化为魔，而道教成为了斩妖除魔的流行职业，贫苦的少年小晋为了成为真正的道士而展开的冒险之旅……